قدیمی ترین طبقه بندی موجودات زنده در جهان از زمان حیات ارسطو (دانشمند یونانی) به ما رسیده است که در آن موجودات را به دو دسته (سلسله) گیاهان و جانوران تقسیم شده است.
طبق این طبقه بندی، گیاهان موجوداتی بدون حرکت، با قابلیت فتوسنتز و با دیواره سلولی سخت از جنس سلولز هستند. جانوران نیز موجوداتی متحرک، بدون فتوسنتز و فاقد دیواره سلولی بودند. طبق این تعاریف، قارچ ها در سلسله گیاهان قرار داشته و تا زمان های طولانی این طبقه بندی اعتبار داشت.
در سال ۱۸۶۶ میلادی، هکل سلسله دیگری به نام آغازیان یا پروتیست ها را تشکیل داد و موجودات تک سلولی از جمله قارچ ها را در آن سلسله قرار داد.
در این طبقه بندی، باکتری ها در کنار قارچ ها و جلبک ها قرار گرفتند. و همین مسئله، این سیستم را با اشکال مواجه کرد تا اینکه در سال ۱۹۶۹ میلادی ویتاکر، موجودات زنده را بر اساس نوع تغذیه و ساختمان سلولی در ۵ دسته طبقه بندی کرد. این سلسله ها عبارتند از:
- سلسله‌ی گیاهان: موجوداتی چند سلولی، با هسته واقعی و فتوسنتز کننده هستند.
- سلسله جانوران: موجوداتی چند سلولی، با هسته واقعی، بلع کننده و فاقد فتوسنتز هستند.
- سلسله قارچ ها: موجوداتی چند سلولی، با هسته واقعی و جذب کننده هستند.
- سلسله آغازیان: موجوداتی تک‌سلولی و با هسته واقعی بوده و شامل پروتوزوآها و بعضی جلبک هل هستند.
- سلسله مونرا: موجوداتی فاقد هسته واقعی بوده و باکتری ها و جلبک های سبز- آبی را شامل می‌شوند.
